Σε συνεχή ετοιμότητα ήταν οι Ένοπλες Δυνάμεις αναφορικά με την εκτίμηση πρόκλησης επεισοδίου στο Φαρμακονήσι. Σύμφωνα με το ΓΕΕΘΑ, με εντολή του ΥΕΘΑ Πάνου Καμμένου, είχε σταλεί στην περιοχή η Κ/Φ ΝΙΚΗΦΟΡΟΣ (Ρ 267), με εντολές να επιτηρεί συνεχώς για ύποπτη δραστηριότητα την ευρύτερη περιοχή.
Προηγουμένως η Άγκυρα είχε εκδώσει οδηγία σύμφωνα με την οποία δέσμευε περιοχή για βολές. Ειδικότερα σύμφωνα με επίσημη ανακοίνωση του ΓΕΕΘΑ αναφέρονται τα εξής
«Τις βραδινές ώρες 16 Φεβρουαρίου 2017, τουρκικές αρχές εξέδωσαν τη NAVTEXΤ 221/17, η οποία προέβλεπε άσκηση πυρών σε περιοχή ανατολικά ν. Φαρμακονησίου, προγραμματισμένη να εκτελεσθεί στις 17 Φεβρουαρίου 2017 από τις 07:00Β έως τις 09:00Β.
Μετά εντολή του Υπουργού Εθνικής Άμυνας ανελήφθησαν όλες οι προβλεπόμενες ενέργειες. Άμεσα εκδόθηκε η NAVTEX 87/17 από την Ελληνική Υδρογραφική Υπηρεσία, η οποία καθιστούσε την ως άνω τουρκική NAVTEX άκυρη λόγω αναρμοδιότητας εκδόσεως αλλά και διότι επικάλυπτε ελληνική επικράτεια. Οι ελληνικές Ένοπλες Δυνάμεις ανέλαβαν άμεση και συνεχή ετοιμότητα παρακολούθησης με αποστολή της Κ/Φ ΝΙΚΗΦΟΡΟΣ(Ρ 267) στην περιοχή.
Από ώρας 0740Β έως 0755Β 17 Φεβρουαρίου 2017, περιπολικό σκάφος του Τουρκικού Πολεμικού Ναυτικού, πλέοντας ανατολικά ν. Φαρμακονησίου και εντός Ελληνικών Χωρικών Υδάτων (ΕΧΥ), εκτέλεσε πυρά με πυροβόλα μικρού διαμετρήματος, με διεύθυνση βολής ανατολικά.
Το εν λόγω περιπολικό καθ’όλη την διάρκεια της κίνησής του, παρακολουθούνταν από την Κ/Φ ΝΙΚΗΦΟΡΟΣ, η οποία εξέπεμπε κείμενα απομάκρυνσής του από τα ΕΧΥ καθώς και διακοπής των δραστηριοτήτων πυρών.
Ακολούθως το τουρκικό πολεμικό πλοίο κινήθηκε βόρεια, απομακρυνόμενο της περιοχής».
